In de kerk is het koor omsloten door 12 kolommen: symbool voor de 12 apostelen. Voltooid was de kerk pas in 1518, toen de tongewelven waren geplaatst.

Ondanks al het nabije oorlogsgeweld van de laatste eeuwen – de vesting Naarden was een strategisch onderdeel van de Hollandse Waterlinie en van groot belang voor de verdediging van Amsterdam – is de Grote Kerk redelijk ongeschonden de tijd doorgekomen. De huidige zeer goede staat van het gebouw heeft zijn basis in de laatste restauratie die duurde van 1965 tot 1978.

Het torenportaal aan de binnenzijde is gedekt met een kruisgewelf, dat in elk der hoeken is versierd met een afbeelding van een der vier kerkvaders: Gregorius, Ambrosius, Hieronymus en Augustinus. Het ronde luik in het gewelf is bedoeld om klokken door te laten.

De Grote Kerk kreeg aan het begin van de 16e eeuw het eikenhouten tongewelf. Het is vervaardigd uit 1600 planken die zowel aan de noordkant als aan de zuidkant verdeeld zijn in elf ‘traveeën’. Deze zijn ter plaatse, direct na het aanbrengen van het gewelf, ca. 25 m boven de begane grond, samen met de trekbalken en sleutelstukken beschilderd. De schilderingen zijn zeer dun, zodat de structuur van het hout zichtbaar is.

Klik!

De kleuren waren oorspronkelijk tamelijk fel, nu hebben ze de tint van oude wandkleden.

Bij de 7,5 jaar durende restauratie zijn alle planken uitgenomen, gereinigd, waar nodig verstevigd en behandeld tegen rot, schimmel en insecten.

De gewelfschilderingen geven aan de noordkant een reeks beelden te zien van Jezus’lijden, sterven en opstanding. Aan de zuidzijde zijn oud-testamentische beelden weergegeven, die steeds een voorbericht zijn van wat er tegenover, nieuw-testamentisch wordt voorgesteld.

Deze in de wereld unieke gewelfschilderingen, zijn aldus een uitbeelding van de eenheid tussen het Oude en het Nieuwe Verbond.

De 23^ste schildering is de bijna halfronde koorsluiting, waarin het Laatste Oordeel is afgebeeld, waar Christus de goeden en kwaden van elkaar scheidt.

Bij de restauratie van dit nog slechts gedeeltelijke aanwezige kunstwerk is vastgesteld dat de schildering werd aangebracht in de droge ondergrond; het tegenovergestelde van een fresco.

De 32 balusters zijn alle verschillend van elkaar en prachtige voorbeelden van houtsnijwerk. Ook het bovengedeelte is voorzien van bijzonder snijwerk. Daarin zijn de hoofden te herkennen van Karel V, graaf van Holland, van landvoogdes Maria van Hongarije en van de toen net overleden Margaretha van Oostenrijk. Tevens zijn aanwezig Anthonie, stadhouder van Holland en van ’t Sticht en van Jan van Alkemade, baljuw van Gooiland.

In het ondergedeelte geeft het houtsnijwerk door symbolen belangrijke gebeurtenissen aan.

De meermin en meerman heffen het wierookvat, als symbool van de teruggave door de zee van de eerder verzwolgen stad Naarden. De twee hoorns van overvloed staan voor de welvaart van Holland, die ook aan Naarden niet voorbij is gegaan.

In een ander ondervlak zien we de Hollandse Leeuw, geflankeerd door twee engelen. De engel met de speer slaapt: het is vrede. De ander draagt een kruis en is wakker: het geloof waakt.

Van deze klok is op tijd een gipsafdruk gemaakt; en in 1949 als model voor een nieuwe klok gebruikt.

De drie overige klokken zijn al in 1810 verkocht; men had de opbrengst nodig vanwege de grote kosten ontstaan door de Franse bezetting. In 1970 zijn als aanvulling weer drie nieuwe klokken gegoten. Het klokje in de dakruiter kwam in 1978 van elders naar de Grote Kerk.

Het klokje dat in de kerk, in de kooromgang naarst de deur naar de consistoriekamer hangt, is afkomstig uit het uurwerk van het orgel, dat van 1520 tot 1862 tegen de westgevel van het kerkschip hing. Het draagt de tekst ‘vincyt amor omnia 1639’ (liefde overwint alles).

	De Grote Kerk beschikt over een kleine reeks bijzondere meubelstukken. Aandacht verdienen de renaissance kansel met zandloper en koperen lezenaars. De oorspronkelijke laat-gothische kansel is nu in het koor te vinden.
Klik!

Voorts heeft de Grote Kerk op tal van plaatsen fraai gebeeldhouwde kopjes op de kraagstenen. Bovendien zijn er enkele schalkbeeldjes. In de noorder dwarsbeuk hangt een ‘Tien-Gebodenbord’ en er tegenover een gildenbord, in 1618 geschonken door het Kleermakersgilde.

Ook zijn twee gedenkplaten aangebracht: één voor stadhouder Willem III en één voor Johan Schoonderbeek, oprichter van de Bachvereniging, die in 1922 in de Grote Kerk van Naarden begon met de wereldberoemde uitvoeringen van de Matthäus Passion van Johann Sebastian Bach.

In 1993 is het beheer van de Grote Kerk van Naarden in handen gegeven van de daarvoor opgerichte Stichting Grote Kerk Naarden.

De Stichting zet zich in om het prachtige gebouw, dat met zoveel gemeenschapsgeld werd gerestaureerd, voor zoveel mogelijke activiteiten een nuttige functie te geven.

De Vereniging Vrienden van de Grote Kerk Naarden, opgericht in 1993, brengt geld bijeen om belangrijke uitgaven voor de Grote Kerk mede te financieren, als deze niet uit de gewone exploitatie kunnen worden bekostigd.